极地冰川的危机解除后，魔法海洋逐渐恢复往日生机。然而，在冰原边缘的一座小岛上，一只名叫可可的小企鹅正蜷缩在巢穴里，眼巴巴地望着远处的海面。自从父母外出觅食后，已经过去整整七天，再也没有回来。
可可的家位于魔法海洋最寒冷的区域——冰晶群岛。这里终年被冰雪覆盖，寒风呼啸而过，卷起层层雪浪。小企鹅们通常会结伴外出寻找食物，可这次，可可的父母却在寻找磷虾群的途中失踪了。
起初，可可并不担心。它相信爸爸妈妈一定会带着美味的磷虾回家，就像以前一样。但随着时间的推移，它开始感到害怕。巢穴外，暴风雪越来越猛烈，小企鹅的肚子也饿得咕咕叫。它试着离开巢穴去寻找食物，可刚走出去没多远，就被呼啸的寒风吹得睁不开眼睛，只好又缩了回来。
就在可可感到绝望时，一个温暖的声音在它耳边响起：“小企鹅，你怎么一个人在这里？”可可抬起头，看到了海昕温柔的脸庞。原来，魔仙们在巡查冰晶群岛时，发现了这座孤零零的小岛上有异常情况，便过来查看。
可可眼泪汪汪地讲述了自己的遭遇。海昕心疼地将它抱在怀里，安慰道：“别害怕，我们一定会帮你找到爸爸妈妈。”希雅用月光棱镜照亮四周，试图寻找可可父母的踪迹；夏凡则启动声波检测仪，在冰面下搜索生命迹象；海达王子和希雪女王则在岛上查看是否有可疑的线索。
经过一番仔细搜寻，夏凡在冰层下发现了一些奇怪的痕迹。“这里有能量波动，和之前遇到的深渊污染有些相似，但又不完全一样。”他皱着眉头说道。众人顺着痕迹追踪，来到了一座巨大的冰山前。冰山内部隐隐透出幽蓝色的光芒，还时不时传来金属碰撞的声音。
“小心，这里很可能有危险。”海达王子握紧王剑，率先走进冰山。冰山内部的景象让他们大吃一惊：里面竟然是一个由寒冰和金属搭建的秘密基地，基地中央有一个巨大的容器，里面装满了闪烁着诡异光芒的液体，而可可的父母和其他一些海洋生物，正被关在容器周围的笼子里。
“爸爸妈妈！”可可激动地喊道。笼子里的企鹅夫妇听到孩子的声音，也不停地呼唤着可可的名字。就在这时，一个戴着黑色面具的神秘人从阴影中走了出来。“你们不该来这里。”神秘人的声音冰冷而低沉，“这些海洋生物是我的实验品，它们体内的能量对我很有用。”
海昕愤怒地说道：“你为什么要这么做？它们都是无辜的生命！”神秘人冷笑一声：“无辜？在这个弱肉强食的世界里，只有强者才能生存。我正在研究一种能让生物获得强大力量的方法，这些海洋生物就是最好的实验对象。”
原来，神秘人是一个痴迷于力量的魔法师。他听说冰晶群岛的生物在极端环境下拥有特殊的能量，便偷偷来到这里，建造了这个秘密基地，抓捕海洋生物进行残忍的实验。他希望通过提取这些生物的能量，让自己变得无比强大，从而统治魔法海洋。
魔仙们不再与神秘人废话，立刻展开战斗。希雅释放月光之力，形成一道道光刃射向神秘人；海昕吹响魔法鱼笛，召唤出一群冰鱼组成冰盾，同时指挥它们攻击神秘人的防御；夏凡则用声波装置干扰基地的能量系统，试图破坏关押海洋生物的笼子。
神秘人也不甘示弱，他挥舞手中的魔杖，召唤出冰锥和暴风雪。冰锥如雨点般向魔仙们射来，暴风雪则让视线变得模糊不清。海达王子和希雪女王联手，用王剑和永冻冰晶挡住了冰锥的攻击，并将暴风雪冻结。
在激烈的战斗中，夏凡成功破解了笼子的机关，可可的父母和其他海洋生物终于重获自由。可可飞快地跑到父母身边，紧紧地抱住它们。企鹅夫妇感动得热泪盈眶，不停地感谢魔仙们的救命之恩。
神秘人见势不妙，想要启动基地的自爆装置，与魔仙们同归于尽。海昕眼疾手快，指挥金飞鱼群冲向神秘人，将他手中的魔杖打落。希雅趁机用月光棱镜将神秘人困住，海达王子迅速上前，将他制服。
危机解除后，魔仙们摧毁了这个邪恶的秘密基地，让冰晶群岛恢复了往日的平静。可可一家和其他被救的海洋生物对魔仙们感激不尽，它们决定在岛上建立一个守护站，共同保护这片家园。
而可可，也从一个胆小的小企鹅变得勇敢坚强。它经常跟着父母和其他企鹅一起巡逻，守护着冰晶群岛的安宁。每当有小企鹅问起它的故事，可可都会骄傲地说：“是魔仙们救了我们，我们也要像他们一样，保护我们的家园，帮助那些需要帮助的伙伴。”
魔仙们继续在魔法海洋中巡逻，他们知道，只要还有邪恶存在，就永远不能放松警惕。但他们也坚信，只要大家齐心协力，就没有战胜不了的困难。而可可一家幸福团聚的画面，也成为了魔法海洋中最温暖的风景，激励着每一个生灵为守护家园而努力。